Gene Ontology Analyses GO Category: BP GO File Creation Date: 07/15/20 Deduplicate Gene Sets: true Data Source: Liver_10-2 FTOH_Female Work Source: Liver_10-2 FTOH_Female_williams_0.05_NOMTC_foldfilter1.5_BMD BMDExpress2 Version: BMDExpress 2.30.0507 BETA Timestamp (Start Time): 02/12/2021 22:59.36 Remove Promiscuous Probes: true Remove BMD > Highest Dose from Category Descriptive Statistics: true Remove BMD with p-Value < Cutoff: 0.1 Remove genes with BMDU/BMDL >: 40.0 Identify conflicting probe sets: 0.5 Category Count: 4400 Total Run Time: 1 seconds GO/Pathway/Gene Set/Gene ID GO Level GO/Pathway/Gene Set/Gene Name All Genes (Expression Data) All Genes (Platform) Input Genes Genes with BMD <= Highest Dose Genes with BMD p-Value >= Genes with BMDU/BMDL <= Genes That Passed All Filters Fisher's A Parameter Fisher's B Parameter Fisher's C Parameter Fisher's D Parameter Fisher's Exact Left P-Value Fisher's Exact Right P-Value Fisher's Exact Two Tail Percentage Entrez Gene IDs Gene 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molecular function in other organism involved in symbiotic interaction 2 2 1 1 0 1 0 0 146 2 2399 0.88862 1.0 1.0 0.0 0 0 0 0 0 GO:0052205 5 modulation of molecular function in other organism involved in symbiotic interaction 2 2 1 1 0 1 0 0 146 2 2399 0.88862 1.0 1.0 0.0 0 0 0 0 0 GO:0052214 3 metabolism of substance in other organism involved in symbiotic interaction 1 1 1 1 0 1 0 0 146 1 2400 0.94268 1.0 1.0 0.0 0 0 0 0 0 GO:0052227 4 catabolism of substance in other organism involved in symbiotic interaction 1 1 1 1 0 1 0 0 146 1 2400 0.94268 1.0 1.0 0.0 0 0 0 0 0 GO:0052229 4 metabolism of macromolecule in other organism involved in symbiotic interaction 1 1 1 1 0 1 0 0 146 1 2400 0.94268 1.0 1.0 0.0 0 0 0 0 0 GO:0052248 7 modulation of programmed cell death in other organism involved in symbiotic interaction 4 5 1 1 0 1 0 0 146 5 2396 0.74424 1.0 1.0 0.0 0 0 0 0 0 GO:0052330 5 positive regulation by organism of programmed cell death in other organism involved in symbiotic 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4,5(0.21);Exp 5,1(0.05);Hill,4(0.17);Linear,6(0.25);Poly 2,3(0.13);Power,1(0.05) 1.8229206220206806 46.289097905159 1.5106481313705444 5.830667972564697 0.9006896532792554 1.6721196174621582 84.38303463249017 190.7570720341764 55.18626033701107 126.29488216298896 169.6955270378333 368.7867146288334 UP 0.625 0.375 0.0 GO:0032386 6 regulation of intracellular transport 104 109 9 9 5 8 4 4 142 105 2296 0.23911 0.88243 0.52405 3.67 25328;24451;293860;25420 lamp1;hmox1;flna;cryab LAMP1_33255;HMOX1_8815;FLNA_8651;CRYAB_33054 204.7002 252.77550000000002 43.6638 108.43098737796316 247.6218994697682 62.24642964422483 146.94265000000001 175.5385 19.7906 87.23545752018875 182.88573219019923 53.51751917151701 346.45664999999997 393.3335 99.8866 172.02050616972974 405.7866392285983 107.11949481314775 236.862;268.689;43.6638;269.586 167.398;183.679;19.7906;216.903 404.026;499.273;99.8866;382.641 4 0 4 25328;24451;293860;25420 LAMP1_33255;HMOX1_8815;FLNA_8651;CRYAB_33054 204.7002 252.77550000000002 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0.3333333333333333 0.6666666666666666 0.0 GO:0031669 5 cellular response to nutrient levels 87 92 15 15 14 13 12 12 134 80 2321 0.99816 0.0053963 0.0053963 13.04 116640;81530;362282;313929;24511;25464;24451;24385;79129;114851;287435;25404 tnc;pdk2;pck1;ncoa1;itgb1;icam1;hmox1;gck;cyba;cdkn1a;cd68;cav1 TNC_33066;PDK2_32491;PCK1_9439;NCOA1_9289;ITGB1_8925;ICAM1_8859;HMOX1_8815;GCK_8697;CYBA_32388;CDKN1A_8271;CD68_8251;CAV1_32536 206.56864833333347 202.6645 1.4105E-12 168.31556007709708 194.0622774176672 164.73431507893895 133.27417083333344 145.5015 1.4105E-12 107.80782086279604 126.45539205602627 106.95059140047941 467.2736250000001 491.9625 1.4105E-12 411.1935595222192 418.895886504513 357.25940044939904 3.5 75.9172 8.5 358.488 54.0417;279.59;381.427;1.4105E-12;136.64;47.1264;268.689;97.7927;335.549;5.45698;411.844;460.667 38.6289;194.225;233.017;1.4105E-12;107.324;16.667;183.679;56.7799;227.443;1.72125;244.474;295.331 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